湖南省卫生厅组织全省卫生系统，全力投入救灾防病。截至6月15日，已派出医疗救护队538批次7296人次，指导环境消毒近500万平方米，并为2万多口水井实施消毒，救治伤病员达11000多人次。

进入6月以来，湖南省大部分地区普降大到暴雨，局部地区降了特大暴雨，永州、郴州、怀化、娄底、湘西土家族苗族自治州等7个市州46个县市区受灾。卫生系统共有96个医疗卫生机构受灾，受淹房屋424间9331平方米，部分医疗设备和药品受损。

灾情发生前，省卫生厅下发了关于做好救灾防病工作的紧急通知，要求各级卫生行政部门和医疗卫生机构进一步修订、完善救灾防病应急预案，落实组织指挥与应急处置医疗救护队名单，切实做好物资与经费储备，扎实开展人员培训与应急演练，全面落实各项救灾防病措施，确保实现大灾之后无大疫的目标。灾情发生后，该厅立即启动救灾防病应急预案。刘家望厅长在第一时间致电受灾最严重的永州市卫生局，对救灾防病工作提出明确要求。

同时，该厅先后向永州市、道县、双牌县、宁远县、桂阳县等重灾区，紧急运送了15万板氟哌酸、2000件漂精片、20吨漂白粉、一批皮肤病防治及杀虫灭鼠等救灾防病药品和物资。灾区卫生部门也多方筹措了价值400多万元的药品和物资。该厅和受灾地区卫生部门迅速派出医疗救护队和防疫机动队，深入受灾现场救治患者、指导环境清理与消毒等工作，确保救灾防病工作顺利开展。

该厅还特别注重加强灾区疫情监测与报告。他们制订下发了霍乱、伤寒、感染性腹泻、乙脑、出血热及钩体病等洪灾相关疾病监测方案，确定了86个疾病监测点，进一步加强了重点地区、重点人群、重点场所的疫情监测。各级卫生部门也根据当地实际制订了疫情监测计划，建立了一般和重点相结合的县、乡、村疫情监测点，加强了对重点传染病和饮食饮水卫生的监测。各级疾控机构和受灾地区卫生部门都坚持实行24小时值班制度。